Ticks的主要概念

从图片当中可以看到,三条染色体上出现了ticks
它们出现的位置也并不是从开始到结尾的

接下来让我们看看子标签tick中的内容是怎么样的

上面的内容上我们也可以发现,这和ideogram标签中对chromosomes的设置几乎是差不多的
通过 chromosomes_display_defaultchromosomes参数控制目标的范围
orientation=in/out 表示显示的方向啦,out就朝外;in朝里;反正radius是可以调整它显示的位置的

使用offsetlabel_offset参数调整ticks位置

offset
label_offset

从图片上可以很明显的看出这两个参数的作用

关于grid的介绍

同样,grid的显示和ideogram上的tick是一样的

接下来是关于tick之间间隔是绝对距离还是相对距离啦

从图中可以发现我把每一段染色体分成了100份的相对长度;然后定义每一个1%为单位长度,在上面打上label标签

关于如何在ideogram上打上单个tick

在每条染色体的开始和结束位置上标明名称

这里的thickness和size属性我是重写了ticks父标签的定义的;

还有一个叫rings的东西;其实也就是在tick标签里的radius属性可以定义很多次;每次的定义都会画出来;不会被后面的定义覆盖!

总结:

Ticks部分的内容就结束啦!以上内容全部来之circos官网,加上本人的实践;如有不对的地方请指正!