Circos基础

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文件目录结构

  1. 首先circos中数据与代码相互分离,方便代码非管理;同时代码也可以实现重复利用
  2. 主要的配置写在circos.conf文件中,其他的配置文件是关于图片其他组件的配置;只需要在circos主配置文件中引入即可
  3. circos在画图时首先从当前路径搜索配置文件,如果没有找到,会到circos软件包所在路径进行配置文件的搜索
    ##相关配置文件etc/housekeeping.conf可以修改设定
    CWD/
    CWD/etc
    CWD/data
    CWD/../
    CWD/../etc
    CWD/../data
    CWD/../..
    CWD/../../etc
    CWD/../../data
    
  4. 有了配置文件接下来circos同样会在当前目录搜索对应的数据文件、配置文件;中如何引用其他文件如下
##circos.conf引用其他配置文件
<<include etc/colors_fonts_patterns.conf>>
<<include etc/housekeeping.conf>>

##circos.conf引用柱状图数据文件
<plots>
<plot>
type=histogram
file=data/Dthighlight.txt
fill_color=rgb(249,105,14)
</plot>
</plots>